Pomerančová šťáva se díky nízkému pH vyznačuje jistou přirozenou odolností proti choroboplodným zárodkům. Při průmyslovém zpracování se používají různé způsoby pasterizace. Šťáva obvykle prochází potrubím vedoucím vedle deskového výměníku tepla, takže se ohřívá bez přímého kontaktu s horkým povrchem. V průběhu procesu pasterizace a plnění dosahuje teplota šťávy 85-94°C po dobu přibližně 30 sekund, což je postačující pro snížení množství choroboplodných zárodků a pro přípravu šťávy k plnění. Pasterizovaná šťáva by se měla do lahví plnit za horka, aby byla zajištěna sterilita procesu. Pokud je to možné, skleněné láhve a plechovky se před plněním předehřívají.

Kapacitní hladinový spínač OPTISWITCH 6500 představuje dobrou volbu pro kontrolu minimální a maximální výšky zaplnění nádrže, hodnotu pH v hotové šťávě je možno měřit např. potenciometrickým senzorem SMARTPAT PH 8570. Pokud se má šťáva plnit do PET lahví nebo plechovek, pak se její objem měří magneticko-indukčním průtokoměrem BATCHFLUX, který je speciálně určen pro použití v plnicích strojích.